劉恒康博士研究方向為利用空間多組學(xué)探究腫瘤細(xì)胞遺傳變異及其與微環(huán)境的相互作用在腫瘤演化過程中的規(guī)律和機制。在本次講座中劉博士分享了一篇發(fā)表于Cancer Cell的封面文章,其中百邁客生物為該研究提供了百創(chuàng)S1000空間轉(zhuǎn)錄組測序服務(wù)。
與以往研究不同的是,這篇文章在研究中同時納入原發(fā)灶以及侵襲性黑色素瘤,結(jié)合多組學(xué)技術(shù)手段,挖掘腫瘤侵襲的克隆演化規(guī)律的同時,發(fā)現(xiàn)了AM(原位肢端黑色素瘤)的C3分子亞型預(yù)后更差,這與C3亞型微環(huán)境中浸潤更多免疫細(xì)胞以及免疫抑制微環(huán)境相關(guān)。其中APOE+/CD163+巨噬細(xì)胞通過IGF1-IGF1R促進了腫瘤細(xì)胞EMT轉(zhuǎn)化,這一發(fā)現(xiàn)也在體外細(xì)胞共培養(yǎng)實驗、額外的患者隊列中得到了驗證,為臨床評估黑色素瘤患者預(yù)后提供了新的視角,即肢端型黑色素瘤組織中APOE+CD163+雙陽與患者更差預(yù)后相關(guān)。
首期 “一作面對面” 腫瘤專題講座圓滿收官,前沿干貨精彩紛呈!
百邁客生物 “一作面對面” 腫瘤專題系列講座將持續(xù)推出肺癌、肝癌、結(jié)直腸癌、胃癌、乳腺癌、宮頸癌、前列腺癌等多癌種專場,致力于打造腫瘤醫(yī)學(xué)領(lǐng)域前沿研究的高端分享平臺 —— 聚焦研究思路與成果的深度交流,探索臨床問題向科學(xué)研究的轉(zhuǎn)化路徑,解析前沿技術(shù)驅(qū)動的認(rèn)知革新,并揭示科研成果的臨床價值落地邏輯。
誠邀腫瘤研究領(lǐng)域?qū)<覍W(xué)者共聚云端
愿思維碰撞出的火花
最終變?yōu)榱一鸱賰舨⊥丛旄V大患者
7月9日19:30
我們下期再會!
]]>中山大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院李霖鋒教授以“雜草稻的起源與適應(yīng)性進化”為題,依托《Nature Communications》發(fā)表的題為”Porous borders at the wild-crop interface promote weed adaptation in Southeast Asia”?的文章,以文章中雜草稻基因組組裝及群體進化為基礎(chǔ),延伸介紹了從雜草稻的表性調(diào)研及分類,馴化過程中的品系選育,馴化關(guān)鍵基因選擇以及雜草稻適應(yīng)性進化研究對栽培水稻育種的重要作用等,整場演講深入淺出,引起了各位老師的熱烈討論。
北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院陳為凱副研究員陳老師則以“本氏煙草完整基因組揭示其著絲粒復(fù)雜結(jié)構(gòu)及進化歷史”為題,詳細(xì)介紹了老師在《Nature Plants》發(fā)表的題為?“The complete genome assembly of Nicotiana benthamiana reveals the genetic and epigenetic landscape of centromeres”?的研究課題,演講內(nèi)容從煙草的T2T基因組組裝開始,深入分析了不同物種著絲粒標(biāo)志序列特征并對其進行分類,整合Chip-seq及甲基化數(shù)據(jù)共同構(gòu)建了本氏煙草著絲粒形成和進化的模型,該模型涉及新著絲粒的形成及反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座子等方面信息,整場演講內(nèi)容詳盡思路完整,也引發(fā)了各位在場老師的思考。
百邁客生物高級產(chǎn)品經(jīng)理聶寧寧圍繞兩位學(xué)者研究中涉及的基因組學(xué)與群體進化研究相關(guān)組學(xué)工具展開深度解析。
這場學(xué)術(shù)盛宴雖已落幕,但其引發(fā)的思考與探索仍在持續(xù)。7月16日14:00,我們將迎來第二期直播。屆時,將有新的行業(yè)權(quán)威專家匯聚一堂,圍繞作物育種領(lǐng)域的新興技術(shù)、前沿理論等展開深入探討,為大家?guī)砀嚓P(guān)于作物育種的創(chuàng)新思路與解決方案。
請持續(xù)關(guān)注百邁客生物官方消息,讓我們共同期待7月16日再次相聚云端,共探作物育種新前沿!
]]>為了推動動物腸道微生物的深入研究,2025年6月24日,百邁客生物特邀三位深耕該領(lǐng)域的權(quán)威專家,以動物營養(yǎng)為核心,開展此次主題學(xué)術(shù)沙龍,圍繞動物腸道微生態(tài)調(diào)控、菌群功能解析、宿主互作機制等熱點議題,帶來高水準(zhǔn)學(xué)術(shù)報告。這不僅是一場知識與思想的盛宴,更是探索動物健康養(yǎng)殖、疾病防控新路徑的交流平臺,讓我們共同探討動物腸道微生物世界的無限可能,攜手推動學(xué)科發(fā)展與技術(shù)革新!
一、反芻動物消化道微生物組互作與功能研究
本次沙龍中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院草原研究所劉孝珍老師探討了反芻動物消化道微生物組研究的重要性,并從不同方向展開:
二、畜禽微生物研究的變與不變
本次沙龍西北農(nóng)林科技大學(xué)武老師對國內(nèi)外關(guān)于畜禽微生物組研究工作進行了整體梳理,從以下七個部分展開:
三、“腸-生殖”軸建立的作用機制探究
本次沙龍內(nèi)蒙古大學(xué)周揚老師介紹了她近幾年的研究成果,基于“腸-生殖”軸建立的相關(guān)作用機制,進一步去開發(fā)羊營養(yǎng)代謝性疾病的繁殖調(diào)控技術(shù),研發(fā)提高羊精液品質(zhì)的飼料添加劑。
通過今天的沙龍,我們對腸道菌群之間的協(xié)同互作,菌群對代謝的影響機制等科學(xué)問題有了更全面的認(rèn)識,也對腸道菌群與宿主的互惠共生關(guān)系有了更深層次的理解。本次沙龍圓滿閉幕,我們將持續(xù)打造第五期微生物領(lǐng)域系列學(xué)術(shù)盛宴,屆時期待與您在科研長河中激蕩思想,共濺新浪花!
]]>發(fā)布會上,百創(chuàng)智造副總裁劉敏詳細(xì)介紹了百創(chuàng)空間ATAC-Seq技術(shù)原理,產(chǎn)品優(yōu)勢,應(yīng)用場景及實測數(shù)據(jù),通過百創(chuàng)獨有的S系列空間芯片作為底層拓展開發(fā),實現(xiàn)單細(xì)胞級空間ATAC-seq,并表示DEMO數(shù)據(jù)預(yù)計1-2周發(fā)布。上海達(dá)澈生物高級產(chǎn)品經(jīng)理王雨琦分享了使用百創(chuàng)空間ATAC-seq得到的實測數(shù)據(jù)。
百創(chuàng)空間ATAC-seq技術(shù)原理
01??提供ATAC的空間位置信息
傳統(tǒng)的 ATAC-Seq 技術(shù)雖然能夠揭示染色質(zhì)的開放性,但無法提供細(xì)胞在組織中的空間位置信息。百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術(shù),能夠在組織切片上直接進行染色質(zhì)可及性分析,保留細(xì)胞的空間信息。
02?解碼基因表達(dá)的空間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
百創(chuàng)空間 ATAC-Seq 技術(shù)能夠同時分析基因表達(dá)和基因調(diào)控機制,為空間生物學(xué)研究增加了新的維度。它可以幫助研究人員在空間維度繪制染色質(zhì)可及性圖譜,揭示基因表達(dá)的調(diào)控機制。
03 多組學(xué)整合:從碎片到全景
空間ATAC-Seq與空間轉(zhuǎn)錄組、空間免疫組、原位熒光等技術(shù)聯(lián)用,實現(xiàn)“表觀遺傳-轉(zhuǎn)錄組-驗證”的多維數(shù)據(jù)整合。這種一體化策略,可幫助科學(xué)家在發(fā)育研究中構(gòu)建更完整的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),甚至發(fā)現(xiàn)此前未知的關(guān)鍵通路。
百創(chuàng)空間ATAC-seq與百創(chuàng)S3000空間轉(zhuǎn)錄組對齊
小鼠胚胎
小鼠腦
肝臟腫瘤
百創(chuàng)智造自主研發(fā)的”空間ATAC-Seq全流程解決方案”,成功填補空間表觀遺傳學(xué)研究領(lǐng)域的商業(yè)化產(chǎn)品空白。該產(chǎn)品通過整合多維組學(xué)分析框架,突破性實現(xiàn)了染色質(zhì)開放區(qū)域的三維空間解析,為科研工作者構(gòu)建”時空分辨-基因調(diào)控”研究體系提供關(guān)鍵工具。其創(chuàng)新性技術(shù)方案將深度賦能發(fā)育分化機制解析、腫瘤免疫微環(huán)境解碼、神經(jīng)退行性疾病研究等重大科學(xué)命題。
未來,百創(chuàng)智造將持續(xù)以技術(shù)創(chuàng)新驅(qū)動行業(yè)發(fā)展,與全球科研伙伴攜手,共同解鎖生命科學(xué)的更多未知奧秘,讓空間生物學(xué)研究從 “單一視角” 邁向 “全景解析” 的新時代!
在測序技術(shù)的不斷發(fā)展中,DNBseq及SURFseq?等國產(chǎn)測序儀的強勢崛起給國內(nèi)育種科學(xué)家提供了多元選擇:DNBseq主要基于DNBSEQ 技術(shù)(DNA納米球測序技術(shù)),結(jié)合聯(lián)合探針錨定聚合(cPAS)技術(shù)實現(xiàn)高通量測序;SURFseq基于“可逆末端終止測序法”技術(shù)路線,突破性推出TB級別桌面測序儀,縮短測序周期。目前,這兩種二代測序技在作物育種中具有廣泛的應(yīng)用,顯著提高育種效率、降低成本,并加速優(yōu)良品種的培育。
文章題目:Improving Seed Shattering Resistance in Wild O. alta Rice with Mesoporous Silica Nanoparticle Delivery Systems[1]
中文題目:介孔二氧化硅納米粒子遞送系統(tǒng)提高野生稻種子易碎抗性
發(fā)表時間:2024.09
當(dāng)前全球局勢下氣候的劇烈變化及人口進一步增長加劇了對糧食作物需求的增長,在農(nóng)業(yè)中會利用野生稻對栽培水稻進行種質(zhì)改良,這一過程的一個關(guān)鍵挑戰(zhàn)是針對種子破碎的問題,種子破碎的物理結(jié)構(gòu)是花梗中的脫落層(AL),其形成受環(huán)境因素和植物激素變化的影響,利用傳統(tǒng)基因工程靶向種子破碎相關(guān)基因的沉默或敲除可以產(chǎn)生種子不破碎的表型,但是難免會對其他表型產(chǎn)生影響,因此本研究開發(fā)了一種利用納米材料介孔二氧化硅納米顆粒(MSNs)改進CRISPR-Cas系統(tǒng)的方法對靶基因進行沉默,這種MSN-siRNA遞送系統(tǒng)可以作為一種靈活可逆的作物性狀改良工具。而其中利用真邁測序平臺SURFseq 5000進行轉(zhuǎn)錄組測序研究了MSN-siRNA遞送系統(tǒng)中各種成分對植物的影響,結(jié)果表明了MSN-siRNA傳遞系統(tǒng)可能通過克服植物細(xì)胞屏障,包括細(xì)胞壁和膜,有效地傳遞siRNA并誘導(dǎo)特定的生理反應(yīng)。
文章題目:The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum[2]
中文題目:類纖維素合酶G3(CslG3)介導(dǎo)鐵皮石斛多糖合成和干旱脅迫反應(yīng)
發(fā)表時間:2024.07
鐵皮石斛(Dendrobium catenatum)是一種著名的觀賞藥用植物,具有增強免疫力、抗氧化作用,這些效應(yīng)歸因于生物活性次生代謝物的積累,包括多糖、類黃酮、生物堿、萜類化合物等,其中,多糖是鐵皮石斛的主要活性成分,具有增強免疫力、降血糖、抗氧化、抗疲勞和抗腫瘤作用,因此,多糖含量是鐵皮石斛的主要質(zhì)量指標(biāo),葡甘露聚糖被認(rèn)為是鐵皮石斛莖中的主要多糖,甘露糖與葡萄糖的比例不同,導(dǎo)致每種葡甘露聚糖的功能存在較大差異。許多研究表明,CesA?基因調(diào)節(jié)甘露聚糖合成,此外,SUS?可以與 CesA?相互作用,為細(xì)胞壁合成提供 UDP-葡萄糖,類纖維素合酶(Csl)基因與 CesA?家族基因具有高度序列相似性,在甘露聚糖的生物合成中起著至關(guān)重要的作用,為了挖掘?qū)е露嗵呛坎町惖墓δ芑?,本研究基于DNBSEQ測序平臺,從兩個多糖含量由顯著差異品種的鐵皮石斛轉(zhuǎn)錄組中鑒定了 Csl?基因家族,并研究了它們的物理化學(xué)性質(zhì)和系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系,又進一步確定了 DcCslG3b?在不同組織中的亞細(xì)胞定位和表達(dá)模式,此外,還測試了 DcCslG3b?介導(dǎo)的非生物脅迫反應(yīng)是否有助于孤立葉片的水分流失率。
文章題目:Sequencing and?analysis of?complete chloroplast genomes of?einkorn wheats?Triticum sinskajae and?Triticum monococcum accession k-20970[3]
中文題目:單粒小麥Triticum sinskajae和Triticum monococcum保藏號k-20970葉綠體全基因組測序與分析
發(fā)表時間:2024.01
單粒小麥包含一粒小麥(Triticum monococcum?L.),野生一粒小麥(Triticum boeoticum?Boiss.) 和烏拉爾圖小麥(Triticum urartu)三種二倍體小麥,而辛斯卡婭小麥(Triticum sinskajae)也經(jīng)常被認(rèn)為是第四種單粒小麥,辛斯卡婭小麥可長到120厘米高,特征為軟質(zhì)的穗殼、較短但更密的穗、較大的小穗和發(fā)育較差的芒,光滑的光澤性穗殼等特征。辛斯卡婭小麥?zhǔn)且环N研究較少的植物,很少被納入禾本科族的系統(tǒng)發(fā)育研究中,因此對其核基因組和葉綠體基因組進行測序非常重要,研究其在黑麥屬中的系統(tǒng)發(fā)育位置也非常有意義,然而目前還有不少科研人員認(rèn)為將辛斯卡婭小麥作為一個獨立物種缺少足夠的證據(jù),因此本次研究目標(biāo)是測序并比較辛斯卡婭小麥和一粒小麥,以及野生一粒小麥的葉綠體基因組,以闡明黑麥的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。本研究中基于真邁國產(chǎn)測序平臺Genolab M對辛斯卡婭小麥和一粒小麥,以及野生一粒小麥的葉綠體基因組進行了測序,結(jié)果表明辛斯卡婭小麥可能是由于生殖隔離產(chǎn)生的一種獨立物種,而不是一粒小麥的突變體。
自10年前DNBSEQ測序技術(shù)的首款國產(chǎn)基因測序儀BGISEQ-500發(fā)布以來,DNBSEQ系列測序平臺已助力發(fā)表超1w+高質(zhì)量文章,建立了國產(chǎn)測序儀的國際口碑,而近兩年來,SURFseq作為國產(chǎn)測序儀的新秀,也以其低成本,通量高及優(yōu)秀的數(shù)據(jù)表現(xiàn)逐漸受到科研人員的認(rèn)可,以下是北京百邁客生物科技有限公司基于SURFseq測序平臺的測試數(shù)據(jù)結(jié)果展示
文庫 | 物種 | 平臺 | 原始產(chǎn)出(G) | 過濾有效率 | useQ30 | Mapped(%) | Unique_mapped | Conversion |
Trans | 玉米 | NovaX | 8.57 | 94% | 94.53 | 88.1% | — | — |
SURF | 8.60 | 97% | 95.98 | 89.1% | — |
— |
||
WGS | 白菜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | 98.6% | — | 91.01% |
SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | 98.8% | — | 91.23% | ||
Lnc | 銀杏 | NovaX | 21.39 | 94% | 93.95 | 95.18% | — | |
SURF | 19.86 | 97% | 95.96 | 95.91% | — | |||
WGBS | 西瓜 | NovaX | 87.54 | 95% | 93.92 | — | 38.84% | 99.58% |
SURF | 92.97 | 96% | 95.47 | — | 41.31% | 99.61% |
真邁SURFSeq 5000與主流進口測序儀同批樣本測試中數(shù)據(jù)表現(xiàn)
每種文庫類型上機4-8個重復(fù),下機統(tǒng)計數(shù)據(jù)質(zhì)量與基礎(chǔ)質(zhì)控結(jié)果,可以看出SURFseq 5000測序結(jié)果整體產(chǎn)出數(shù)據(jù)高質(zhì)量數(shù)據(jù)及有效數(shù)據(jù)比例更高,比對率覆蓋度等指標(biāo)與Nova X plus平臺相比基本持平,數(shù)據(jù)質(zhì)量穩(wěn)定可靠。
Trans及LncRNA文庫SURFseq 5000及Nova X plus平臺各重復(fù)樣本相關(guān)性統(tǒng)計,整體相關(guān)性在98%以上,數(shù)據(jù)分析結(jié)果與主流平臺結(jié)果一致性較高。
甲基化DMR分析結(jié)果顯示,SURFseq 5000 測序數(shù)據(jù)(Z007及Z008)鑒定DMR數(shù)要多于Nova X plus測序同批數(shù)據(jù)(B921-7及B921-8),且根據(jù)韋恩圖統(tǒng)計結(jié)果來看,SURFseq 5000 測序兩個重復(fù)樣本重合的DMR較Nova X plus測序的兩重復(fù)樣本更多,測序結(jié)果一致性更好。實測數(shù)據(jù)顯示:SURFseq能夠完美復(fù)刻甚至優(yōu)于國際主流平臺的數(shù)據(jù)質(zhì)量。
2025年,為了加速國產(chǎn)優(yōu)質(zhì)作物種質(zhì)培育及推動優(yōu)化國內(nèi)糧食作物產(chǎn)業(yè)結(jié)構(gòu),北京百邁客生物科技有限公司投放百萬補貼正式啟動【優(yōu)種計劃】! 該計劃將聚焦水稻、小麥、大豆等糧食作物及棉花,油菜等經(jīng)濟作物,基于優(yōu)質(zhì)國產(chǎn)平臺,覆蓋基因組學(xué)、群體研究、轉(zhuǎn)錄表觀組學(xué)等多種科研技術(shù)致力于構(gòu)建國產(chǎn)種質(zhì)資源基因數(shù)據(jù)庫,為培育高產(chǎn)、抗逆、優(yōu)質(zhì)新品種提供精準(zhǔn)導(dǎo)航。
一粒良種,萬物生長。讓我們用基因密碼解鎖豐收未來,共同筑牢大國糧倉根基,掃描下方二維碼報名即有機會加入本次科研助農(nóng)計劃!
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【參考文獻】
1: Liu Z, Zhang J, Cai Y, Wang H, Luo M, Li J, Yu H, Meng X, Cao Y. Improving?Seed Shattering Resistance in Wild <i>O. alta</i> Rice with Mesoporous Silica?Nanoparticle Delivery Systems. Nano Lett. 2024 Sep 25;24(38):11823-11830. doi:10.1021/acs.nanolett.4c02297.
2:Hongyan Hou, Junxia Wu, Yu Zhang, Chenfei Lu, Wu Jiang, Yanghui Shen, Lanying Pan, Qingsong Shao, Aimin Lv,The cellulose synthase-like G3 (CslG3) gene mediates polysaccharide synthesis and drought stress response in Dendrobium catenatum,Scientia Horticulturae,https://doi.org/10.1016/j.scienta.2024.113514.
3:Kuluev, A., Kuluev, B., Mikhaylova, E. et al. Sequencing and analysis of complete chloroplast genomes of einkorn wheats Triticum sinskajae?and Triticum monococcum?accession k-20970. Genet Resour Crop Evol 71, 3347–3360 (2024). https://doi.org/10.1007/s10722-023-01843-x
]]>國家級專精特新“小巨人”是工業(yè)和信息化部為貫徹落實中共中央辦公廳、國務(wù)院辦公廳《關(guān)于促進中小企業(yè)健康發(fā)展的指導(dǎo)意見》《財政部工業(yè)和信息化部關(guān)于支持“專精特新”中小企業(yè)高質(zhì)量發(fā)展的通知》有關(guān)要求,經(jīng)各省級中小企業(yè)主管部門會同財政部門組織報送、專家審核等流程評選而出,是中小企業(yè)評定工作中最高等級、最具權(quán)威的榮譽稱號。
專精特新“小巨人”企業(yè)是“專精特新”企業(yè)中的佼佼者,也是專注于產(chǎn)業(yè)細(xì)分市場、創(chuàng)新能力強、市場占有率高、掌握產(chǎn)業(yè)鏈關(guān)鍵環(huán)節(jié)核心技術(shù)、質(zhì)量效益優(yōu)的排頭兵企業(yè)。
百邁客生物獲得國家級專精特新“小巨人”企業(yè)認(rèn)定,不僅是對公司深耕基因測序領(lǐng)域開展技術(shù)創(chuàng)新、市場開拓、管理提升、戰(zhàn)略轉(zhuǎn)型等方面所取得成果的認(rèn)可,更是對公司長期以來堅持自主創(chuàng)新,強化研發(fā)投入的高度肯定。未來,百邁客生物將充分發(fā)揮專、精、特、新的企業(yè)優(yōu)勢,加強技術(shù)創(chuàng)新,不斷提升產(chǎn)品質(zhì)量和市場競爭力,為行業(yè)發(fā)展做出更大貢獻!
發(fā)布會中,百邁客生物智能制造副總裁劉敏對百創(chuàng)S3000空間轉(zhuǎn)錄芯片的性能進行了詳細(xì)介紹。百創(chuàng)S3000在6.8mm*6.8mm的捕獲區(qū)域內(nèi)鋪設(shè)了4,144,770個捕獲位點,相鄰兩個捕獲位點的中心距為3.5μm。相較于現(xiàn)在廣受市場認(rèn)可與好評的百創(chuàng)S1000轉(zhuǎn)錄組芯片,捕獲位點數(shù)提升近2倍,分辨率同樣提升近2倍。
相同組織類型,相同數(shù)據(jù)飽和度下,單細(xì)胞級分辨率下,中位基因數(shù)提升30%-60%,中位UMI提升30%-70%。
實際密度效果提升動圖展示:
同時,從性能上看,百創(chuàng)S3000芯片的發(fā)布,也將進一步加強百創(chuàng)產(chǎn)品“原片無錯高清H&E+原片無錯熒光+原片測序”的效果,“三片合一”實現(xiàn)更加精準(zhǔn)的細(xì)胞分割,將空間轉(zhuǎn)錄組推進到單細(xì)胞分辨率的領(lǐng)域,使空間組學(xué)性能更進一步。
三片合一
發(fā)布會現(xiàn)場,百邁客生物創(chuàng)始人兼CEO鄭洪坤說到,百邁客生物在為從事生命科學(xué)研究機構(gòu)和企業(yè)提供高品質(zhì)、高質(zhì)量的多組學(xué)研究服務(wù)同時,將會繼續(xù)加大科研力量研發(fā)投入,在智能制造方向打造更多推動行業(yè)發(fā)展的高精尖產(chǎn)品,以空間組學(xué)這一未來技術(shù)趨勢,做精做強百創(chuàng)系列產(chǎn)品,從而利用自身科研服務(wù)和智能制造雙驅(qū)動,助力中國科研事業(yè)向前向快發(fā)展。
百邁客生物創(chuàng)始人兼CEO 鄭洪坤
百創(chuàng)S3000的首批體驗用戶在現(xiàn)場分享了試用體驗:
中國科學(xué)院北京基因組研究所終身榮譽研究員于軍老師表示,百邁客生物的百創(chuàng)S3000在精準(zhǔn)醫(yī)療中起著重要的推動作用,未來至少三十年,空間組學(xué)技術(shù)的發(fā)展將越來越受到大家更多的重視。
中國科學(xué)院北京基因組研究所? 于軍研究員
廣東省人民醫(yī)院費繼鋒研究員結(jié)合自身產(chǎn)品體驗,認(rèn)為百創(chuàng)S3000這個產(chǎn)品的分辨率可以更高更小地縮小這個“局部”,尤其分割之后就可以直接局部成單個細(xì)胞,從而得到更為精準(zhǔn)的結(jié)果。
廣東省人民醫(yī)院 費繼鋒研究員
北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院李博生研究員表示,百創(chuàng)S3000相比S1000來講,在相同的捕獲區(qū)域內(nèi)捕獲位點數(shù)及分辨率提升了2倍,更重要的是在相同的單細(xì)胞分辨率下,中位基因數(shù)跟中位UMI都有了30%-70%的提升,這將有利于我們能更好的去解讀信息。
北京大學(xué)現(xiàn)代農(nóng)業(yè)研究院 李博生研究員
中國海洋大學(xué)王瑋教授認(rèn)為,百創(chuàng)S3000空間技術(shù)對研究海鞘這類個體微小的物種具有重要意義。精細(xì)的結(jié)構(gòu)需要精細(xì)的技術(shù)去進行研究的支撐,如果使用傳統(tǒng)的空間技術(shù)就很難就解析比較細(xì)微的結(jié)構(gòu),百創(chuàng)S3000的性能再疊加百創(chuàng)智造的細(xì)胞分割技術(shù),能夠?qū)⒉煌愋偷募?xì)胞進行分割和識別。
中國海洋大學(xué) 王瑋教授
這一榮譽不僅是對百邁客生物的認(rèn)可,更是對我們在智能制造領(lǐng)域所做的杰出貢獻的肯定。百邁客生物將繼續(xù)致力于技術(shù)創(chuàng)新和智能制造產(chǎn)業(yè)升級,為推動先進制造業(yè)的發(fā)展貢獻更多的力量。
作為基因測序服務(wù)和產(chǎn)品提供商,2023年百邁客生物聚焦科技服務(wù)、智能制造等優(yōu)勢,布局亞太、北美等海外市場,推出凝聚公司多年的時空組學(xué)創(chuàng)新技術(shù),持續(xù)轉(zhuǎn)化單細(xì)胞、空間轉(zhuǎn)錄組芯片等商業(yè)化產(chǎn)品。
面向未來,百邁客生物將進一步筑牢企業(yè)發(fā)展根基、加大科研創(chuàng)新投入、持續(xù)提升核心競爭力,秉承提供超越客戶期望的產(chǎn)品和服務(wù)為使命,以實際行動提升企業(yè)經(jīng)濟價值、產(chǎn)業(yè)價值和社會價值,為推動基因經(jīng)濟高質(zhì)量發(fā)展發(fā)揮積極作用。
百創(chuàng)智造BMKMANU S系列空間轉(zhuǎn)錄組芯片是基于微孔微珠的亞細(xì)胞級空間轉(zhuǎn)錄組產(chǎn)品,最高分辨率4.8μm ,并開創(chuàng)性的將組織原片H&E染色,原片熒光染色及原片高通量測序相結(jié)合進行精準(zhǔn)的細(xì)胞分割,實現(xiàn)精準(zhǔn)的單細(xì)胞級空間轉(zhuǎn)錄組測序,極大地推動了基礎(chǔ)科研發(fā)展,目前在發(fā)育疾病、生理學(xué)疾病、胚胎發(fā)育、干細(xì)胞分化、繪制3D圖譜、生殖健康、腫瘤等領(lǐng)域廣泛應(yīng)用。
百創(chuàng)S系列空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)原理圖
百創(chuàng)智造自主研發(fā)的單細(xì)胞平臺–百創(chuàng)DG1000,是基于微流控、油滴包裹和Barcode標(biāo)記等技術(shù)來實現(xiàn)高通量的細(xì)胞捕獲。除了儀器以外,百創(chuàng)DG1000還有配套的2×4的獨立芯片、GEM形成試劑盒、純化試劑盒、以及建庫試劑盒。
百靈全自動化平臺是百邁客生物面向科技服務(wù)領(lǐng)域推出的高通量測序多產(chǎn)品并行的全自動化智能交付平臺,兼容8大產(chǎn)品類型(WGS、RNA-seq、擴增子、LncRNA-seq、SLAF-seq、ISO-seq、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組、建庫測序產(chǎn)品)共線并行。其具有高通量、自動化、信息化和智能化等特點,支持7×24小時工作,支持多任務(wù)并行,系統(tǒng)模塊化設(shè)計,每臺設(shè)備均支持離線和在線使用,通過條碼實現(xiàn)數(shù)據(jù)追蹤和溯源。
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2018年,“單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組技術(shù)”被Science評為年度突破技術(shù),引領(lǐng)了單細(xì)胞測序的熱潮。但略有遺憾的是,單細(xì)胞數(shù)據(jù)沒有空間位置信息。人類的疾病通常始于單細(xì)胞并擴散于空間之上。隨后,“空間轉(zhuǎn)錄組”應(yīng)運而生,并在2020年被Nature Methods評為年度技術(shù)方法!在2022年被Nature評為值得關(guān)注的七大技術(shù)之一!在可預(yù)見的未來,空間轉(zhuǎn)錄組必將走向成熟的單細(xì)胞乃至亞細(xì)胞分辨率水平,從而引領(lǐng)下一波熱浪!
2021年,空間轉(zhuǎn)錄組正式發(fā)表文章有40余篇,而在預(yù)印本bioRxiv搜索“空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)(spatial transcriptomics)”一詞,獲得了500余條結(jié)果,可以說2021年是空間轉(zhuǎn)錄組技術(shù)應(yīng)用好文發(fā)表突飛猛進的一年。通過進一步分析發(fā)現(xiàn),大多數(shù)文章的影響因子在10分以上,且應(yīng)用場景也由人和鼠的不同組織部位,拓展到了哺乳動物(豬)、家禽類(雞)、植物類(擬南芥、云杉、楊樹)等新的物種領(lǐng)域。
北京生信培訓(xùn)班會場
百邁客時空組學(xué)研發(fā)總監(jiān)在培訓(xùn)中給學(xué)員作操作演示
青島生信培訓(xùn)班會場
然而,這場降雪也給市民的生活和工作帶來了一定的影響。為了保障大家的出行安全,百邁客黨支部積極發(fā)揮戰(zhàn)斗堡壘作用,組織黨員們參與了辦公樓宇門前的除雪活動。
在這次除雪活動中,百邁客黨支部的黨員們身先士卒,帶頭示范,帶領(lǐng)著其他員工一起投入到除雪工作中。他們手持鐵鍬、掃把等工具,不畏嚴(yán)寒,奮力清除著辦公樓宇門前的積雪。在大家的共同努力下,門前的雪很快就被清除干凈,道路變得暢通無阻。
這次除雪活動不僅保障了大家的出行安全,也讓百邁客黨支部黨員們展現(xiàn)出了良好的精神風(fēng)貌和團隊協(xié)作精神。他們用實際行動踐行了黨的群眾路線,發(fā)揮了黨員的先鋒模范作用,也為公司的形象增添了亮色。
讓我們向百邁客黨支部和所有參與除雪活動的黨員們表示敬意和感謝!在未來的日子里,讓我們一起發(fā)揚這種團結(jié)協(xié)作、無私奉獻的精神,為公司的發(fā)展和社會的進步貢獻自己的力量!
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