高密度遺傳圖是如何輔助基因組組裝的？

通過共線性分析，將遺傳圖譜上的標(biāo)記與初步組裝得到的scaffold進(jìn)行比對(duì)，統(tǒng)計(jì)不同scaffold上的標(biāo)記數(shù)目，得到不同連鎖群上被錨定的scaffold信息，一個(gè)scaffold上如果錨定兩個(gè)以上的標(biāo)記，該scaffold的位置和方向均可以被定位到染色體水平。只有1個(gè)標(biāo)記則只能定位到位置，方向不能確定。如果沒有錨定到標(biāo)記，則該scaffold仍然不能被定位到染色體水平，說明該scaffold多態(tài)性可能較差，需要構(gòu)建更加精細(xì)的遺傳圖譜。