什么是eQTL，和基于DNA水平開發(fā)SNP的區(qū)別？

1）表達數量性狀基因座（expression Quantitative Trait Loci,eQTL）是指的是染色體上一些能特定調控mRNA和蛋白質表達水平的區(qū)域，其mRNA/蛋白質的表達水平量與數量性狀成比例關系，將各基因型的表達數據作為一個數量性狀，利用傳統(tǒng)的QTL分析方法進行分析。eQTL可分為順式作用eQTL和反式作用eQTL，順式作用eQTL就是某個基因的eQTL定位到該基因所在的基因組區(qū)域，表明可能是該基因本身的差別引起的mRNA水平變化；反式作用eQTL是指某個基因的eQTL定位到其他基因組區(qū)域，表明其他基因的差別控制該基因mRNA水平的差異。

2）基于轉錄組測序的關聯(lián)分析是從SNP關聯(lián)分析與GEM關聯(lián)分析兩個水平實現(xiàn)的，開發(fā)的SNP位于基因編碼區(qū)域，SNP與基因(或Unigene)所屬關系是已知，加上基因表達水平的關聯(lián)分析就能夠實現(xiàn)功能基因的精細定位。