什么是eQTL，和基于DNA水平開發(fā)SNP的區(qū)別？

1）表達(dá)數(shù)量性狀基因座（expression Quantitative Trait Loci,eQTL）是指的是染色體上一些能特定調(diào)控mRNA和蛋白質(zhì)表達(dá)水平的區(qū)域，其mRNA/蛋白質(zhì)的表達(dá)水平量與數(shù)量性狀成比例關(guān)系，將各基因型的表達(dá)數(shù)據(jù)作為一個(gè)數(shù)量性狀，利用傳統(tǒng)的QTL分析方法進(jìn)行分析。eQTL可分為順式作用eQTL和反式作用eQTL，順式作用eQTL就是某個(gè)基因的eQTL定位到該基因所在的基因組區(qū)域，表明可能是該基因本身的差別引起的mRNA水平變化；反式作用eQTL是指某個(gè)基因的eQTL定位到其他基因組區(qū)域，表明其他基因的差別控制該基因mRNA水平的差異。

2）基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的關(guān)聯(lián)分析是從SNP關(guān)聯(lián)分析與GEM關(guān)聯(lián)分析兩個(gè)水平實(shí)現(xiàn)的，開發(fā)的SNP位于基因編碼區(qū)域，SNP與基因(或Unigene)所屬關(guān)系是已知，加上基因表達(dá)水平的關(guān)聯(lián)分析就能夠?qū)崿F(xiàn)功能基因的精細(xì)定位。